โรคภูมิต้านตนเองเกิดขึ้นเมื่อระบบภูมิคุ้มกันโจมตีอวัยวะของร่างกาย ตัวอย่างเช่น โรคเบาหวานประเภท 1 เกิดจากการทำลายเซลล์ตับอ่อนที่ผลิตอินซูลินอย่างผิดพลาด หลายเส้นโลหิตตีบเป็นโรคภูมิต้านตนเองที่พบบ่อยที่สุดของระบบประสาทส่วนกลาง โรคนี้มีลักษณะเฉพาะโดยการทำลายไมอีลินซึ่งเป็นฉนวนป้องกันของเซลล์ประสาทและมีความสำคัญสำหรับการส่งสัญญาณไฟฟ้าที่ถูกต้องและรวดเร็ว

การทำลายล้างจึงนำไปสู่ความพิการทางระบบประสาทรวมถึงอัมพาต กลไกการป้องกันของร่างกายเราต่อสภาพแวดล้อมที่เป็นปรปักษ์นั้นมีราคาแพงมาก และสามารถถูกจำกัดด้วยการแลกเปลี่ยนเมื่อมีการเปิดใช้งานหลายๆ อย่าง ดังนั้น สิ่งมีชีวิตอาจต้องจัดลำดับความสำคัญของการจัดสรรทรัพยากรในโปรแกรมการป้องกันต่างๆ ขึ้นอยู่กับค่าการอยู่รอดของพวกมัน สิ่งนี้อาจเป็นที่สนใจเป็นพิเศษสำหรับภูมิคุ้มกันทำลายตัวเอง ซึ่งการแนะนำโปรแกรมที่ใช้พลังงานราคาแพงเพิ่มเติมอาจส่งผลให้ภูมิคุ้มกันตอบสนองและผลของโรคน้อยลง กล่าวอีกนัยหนึ่ง เราสามารถเบี่ยงเบนพลังงานที่ร่างกายใช้ไปเมื่อระบบภูมิคุ้มกันผิดพลาด